有几把功能性钥匙对于探索游戏世界至关重要，它们分别是用于开启沙漠骷髅洞穴的头骨钥匙、用于进入城镇下水道的生锈钥匙，此外在一些额外的游戏模组中也可能存在特定的钥匙。这些钥匙的获取途径是固定的，且通常与游戏的核心进程和收集要素紧密关联。
头骨钥匙是进入沙漠区域骷髅洞穴的必备道具，其获取地点位于鹈鹕镇的普通矿井深处。玩家需要将这座矿井探索至最底层，即第120层，并在该层的中央区域找到一个宝箱，打开这个宝箱即可获得头骨钥匙。在多人游戏模式下，只要有一名玩家获得了这把钥匙，其他所有玩家都会自动在收集界面中解锁该道具，无需重复获取流程。
获得头骨钥匙后，你需要前往沙漠以使用它。前往沙漠的前提是修复小镇的巴士站，这可以通过完成社区中心的献祭任务或直接向乔家超市支付费用来实现。修复后，便可在上午十点至下午五点间花费金币乘坐巴士前往沙漠，骷髅洞穴的入口就位于沙漠地图的西北角，使用头骨钥匙即可打开洞穴大门开始新的挖掘挑战。
另一把重要的钥匙是生锈的钥匙，它用于开启位于小镇广场下方森林区域的下水道入口。这把钥匙的获取与博物馆的捐赠进度直接挂钩，玩家需要向位于铁匠铺上方的博物馆馆长捐赠累计60件文物或矿石。当捐赠总数达到要求后，馆长会在次日亲自拜访你的农场并赠送生锈的钥匙，之后你便可前往下水道位置，使用钥匙打开铁门进入其中，遇见特殊的NPC并购买稀有物品。
