被感染的房间（疫变之巢）是飞船内的特殊功能区域，开启该房间需要完成特定条件。首先需通过火卫二魔胎之境的隔离库任务获取殁世机甲部件，随后在飞船内安装Helminth模块。该模块需消耗特定资源建造，包括从魔胎之境采集的矿石、鱼类或母亲声望兑换的材料。安装完成后，飞船左侧原本锁定的房间将变为可进入状态，但需注意模块建造期间需保持在线或确保资源充足。
进入被感染的房间后，核心功能是Helminth系统，允许玩家通过喂食资源或牺牲战甲来强化战甲技能。喂食时需关注材料标记，绿标材料可提供30%饥饿度，满绿标喂食效率最高，红标材料则收益极低。每次喂食会改变材料标记状态，系统会随时间自动恢复绿标。牺牲战甲需穿戴目标战甲后与Helminth交互，被吸收的战甲将永久消失并解锁其特定技能，该操作存在24小时冷却且无法加速。技能注入会消耗饥饿度，取消注入则不消耗。
战甲感染孢子是被感染房间的关联机制。当玩家使用非殁世机甲战甲与携带疫变之巢的队友组队时，战甲颈部会生长感染瘤，7天后成熟可进入房间。成熟瘤体可用于孵化异变犬或通过手术永久清除，若选择孵化，瘤体会再次生长周期。殁世机甲战甲（如蛆甲）无需感染可直接进入房间，这是唯一不受限制的进入方式。
资源管理与战略规划是高效利用该房间的关键。建议优先喂食高价值绿标材料，避免强行喂食红标材料造成浪费。牺牲战甲前需确认其技能价值与自身需求匹配，技能注入可针对不同配置方案独立操作。房间等级提升可增加吸取槽位，最高等级取消上限限制，但升级过程需持续投入资源。隔离库任务中获取的殁世机甲MOD可通过母亲声望兑换，这是强化机甲战力的重要途径。
被感染的房间作为后期玩法核心，其功能与火卫二魔胎之境深度绑定。玩家需持续参与隔离库任务获取高级资源，同时合理规划Helminth系统的技能组合。该系统对战斗风格的影响具有不可逆性，每次操作前需谨慎评估战甲价值与技能实用性。
