明日之后第三季新增了多个副本分布在不同的地图中，其中红杉茶会副本位于红杉镇，需要采集等级达到90级才能解锁。这个副本分为强袭帮据点、护卫队据点和后山教堂三个阶段，最终目标是击败变异新郎。进入副本后联盟会提供后勤补给支持，包括装备耐久消耗减免90%等福利，通关后能获得战斗熟练度、精密透镜和新币奖励。
位于莱文市区域，采用五层渐进式挑战设计。每层都有独特的BOSS和机关陷阱，需要团队配合破解。建议携带喷火器清理尸潮，使用冷兵器对付带盾怪物，电梯环节需要收集蓝色气泡数据，终极BOSS战需分散站位依次击破三个分身。副本中地形复杂，要注意躲避通电地面和跳跃技能。
黄沙戈壁副本位于沙石堡，是第二季新增的区域行动玩法。推荐佩戴红甲和护盾进入，第一部分建议用狙击手卡掩体点杀，避免被电棍麻痹。第二部分需要守住阵地快速击杀会召唤援兵的女僵尸。BOSS战要注意躲避大风车、吐口水、击飞等技能，其中大风车持续15秒但可以被高输出打断。副本还包含废弃车间、电力中心等四个区域，每个区域有独特解谜要素。开局可从箱子获取隐身衣，下蹲进入隐身状态后第一枪有伤害加成，特别适合狙击手发挥。需要注意毒气实验室要提前准备解毒剂，机械工厂则需要团队配合破解多重机关。
海岛暗礁副本在新增的海岛地图，主打水陆交替作战。主要环节包括清理帽子怪、对抗利维坦海怪等，开发电机阶段建议在门后放置减速装置。最终BOSS战要注意不同部位的孢子伤害差异，优先攻击高伤害区域。这个副本对走位要求较高，需要熟悉水陆环境切换。大剧院副本位于莱文市黎明区，强调团队协作与机关互动。舞台区域有灯光伤害机制和陷阱，12分钟内通关可获SS评级。建议携带高爆发武器和血清类补给品，合理分配队员站位。副本中有些机关需要特定职业破解，组队时最好保证职业搭配均衡。
